「発行されたSQL文のログを(Loggerなどに)出力させるにはどうするのだろう？」
という疑問をもちました。
そこで、

Seasar2 - S2JDBC - その他の機能
http://s2container.seasar.org/2.4/ja/s2jdbc_other.html

に「SQLのログ」という項があるので、これを見たのですが、
「SQLのログ」というよりは「発行されたSQLの参照」というタイトルが相応しい
内容かと思います。

また、「SQLのログ」という項として、

ログカテゴリ
org.seasar.extension.jdbc.query
のレベルをDEBUGにすると、発行されたSQLをログに記録できる。

というような内容を追加して頂けると、よいのではないかと思います。